More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1598 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 349 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  64.93 
 
 		 365 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  50.29 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  50.15 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  44.76 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  45.67 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  47.42 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  48.66 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  45.05 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  44 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  44.78 
 
 		 369 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  42.3 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  40.66 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  41.81 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  39.35 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  38.28 
 
 		 468 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 435 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  37.36 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  37.24 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  37.46 
 
 		 432 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  32.53 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 405 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.14 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  26.56 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  25.95 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29.15 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.14 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.74 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  24.76 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.81 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.96 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  28.79 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.96 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.7 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.29 
 
 		 371 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.29 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  22.51 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.7 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.95 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 667 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.7 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.57 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.57 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.91 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.91 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  32.03 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.35 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  26.02 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>