More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3948 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
374 aa  752    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  97.79 
 
 
374 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  52.86 
 
 
388 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  46.96 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  46.96 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  46.94 
 
 
384 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  44.71 
 
 
385 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  42.18 
 
 
365 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  39.36 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  40.23 
 
 
458 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  39.12 
 
 
432 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  37.39 
 
 
435 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  37.39 
 
 
435 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  39.65 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  37.1 
 
 
435 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  37.4 
 
 
370 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  38.3 
 
 
433 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  40.23 
 
 
405 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 
374 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  39.19 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 
372 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 
356 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  33 
 
 
331 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 
392 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
398 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  31.71 
 
 
344 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.16 
 
 
338 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 
369 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  35.1 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  31.83 
 
 
369 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  29.12 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 
325 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
363 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.74 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
324 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  34.52 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.79 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
332 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  34.41 
 
 
357 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
321 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  28.09 
 
 
330 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
336 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
361 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 
667 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
667 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.36 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  30.21 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 
667 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 
342 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  32.96 
 
 
667 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  31.66 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
332 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 
320 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 
328 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
328 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
347 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.51 
 
 
328 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.31 
 
 
317 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.25 
 
 
337 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.75 
 
 
312 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.99 
 
 
328 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  36.19 
 
 
665 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 
366 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  30.79 
 
 
329 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
327 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  30.39 
 
 
328 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 
334 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
315 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.49 
 
 
313 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  27.44 
 
 
328 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.13 
 
 
335 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
322 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 
329 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.38 
 
 
342 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
355 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  32.26 
 
 
344 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
345 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.14 
 
 
359 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.59 
 
 
342 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 
338 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  31.27 
 
 
358 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
329 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  32.66 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>