More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1312 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
331 aa  688    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  53.4 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  50.91 
 
 
327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  50.15 
 
 
328 aa  322  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  48.91 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  49.33 
 
 
354 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  43.56 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  38.39 
 
 
324 aa  239  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 
320 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
330 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
356 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.25 
 
 
331 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 
337 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
667 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
331 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
365 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
347 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
345 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 
321 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.64 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  34.8 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 
338 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  31.06 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  33.68 
 
 
342 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
327 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
327 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
334 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 
400 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
326 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.17 
 
 
399 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 
320 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.68 
 
 
438 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.93 
 
 
334 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.67 
 
 
359 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
340 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
334 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
350 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
385 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  28.31 
 
 
363 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 
329 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
391 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
385 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 
376 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
321 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
378 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.93 
 
 
329 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
404 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.93 
 
 
428 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.11 
 
 
388 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
327 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  27.46 
 
 
362 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
329 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
334 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
334 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.15 
 
 
353 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.07 
 
 
387 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
332 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
342 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
356 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.23 
 
 
404 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  32.16 
 
 
355 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
376 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
358 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.54 
 
 
371 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.54 
 
 
371 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.47 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
346 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.29 
 
 
335 aa  99  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
362 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
334 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.17 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
335 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
321 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 
331 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 
353 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.04 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  26.52 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>