More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3595 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
331 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  78.96 
 
 
342 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  78.59 
 
 
342 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  78.59 
 
 
342 aa  474  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  75.62 
 
 
343 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  53.75 
 
 
327 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  50 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.81 
 
 
333 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.81 
 
 
333 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 
333 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  33.46 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 
334 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
331 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 
347 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  35.58 
 
 
336 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
374 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  33.21 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.47 
 
 
349 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
382 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.93 
 
 
386 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
332 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 
354 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  30.62 
 
 
327 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.37 
 
 
353 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  40.2 
 
 
324 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
382 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 
331 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  31.49 
 
 
337 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.36 
 
 
327 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
387 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 
363 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 
385 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.62 
 
 
335 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  36 
 
 
378 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
338 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 
334 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.24 
 
 
334 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.06 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 
387 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
326 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.86 
 
 
370 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  32.03 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  34.98 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  32.66 
 
 
390 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  22.9 
 
 
331 aa  95.9  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  37.87 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.21 
 
 
369 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
349 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
350 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
337 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.66 
 
 
390 aa  93.6  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
373 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  37.06 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
345 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
397 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
347 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.8 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  35.51 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  30.67 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
381 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.37 
 
 
344 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  36.28 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
435 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  26.12 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 
359 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 
390 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  34.52 
 
 
395 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 
399 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.35 
 
 
387 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
345 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 
336 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  33.64 
 
 
390 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  32.55 
 
 
396 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 
389 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 
667 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>