More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2804 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 342 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  92.4 
 
 		 342 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  92.4 
 
 		 342 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  78.96 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  77.06 
 
 		 343 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  52.24 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  52.29 
 
 		 353 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  34.06 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.9 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.9 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  34.69 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  35.06 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  33.94 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.63 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.95 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.95 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 		 435 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  33.82 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  32.19 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  30.59 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.1 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  36.01 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  33.05 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  28.36 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  34.96 
 
 		 369 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 667 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.79 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  24.2 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  32.24 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  32.99 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  33.9 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  37.04 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  30.74 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  39.34 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.28 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.57 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.01 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.68 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  37.84 
 
 		 388 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  32.86 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.15 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  30.25 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  28.53 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 380 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  24.9 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  28.9 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>