More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2048 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
333 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  99.1 
 
 
333 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  92.19 
 
 
333 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  71.17 
 
 
333 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  61.77 
 
 
345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  59.33 
 
 
336 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  55.28 
 
 
334 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  57.27 
 
 
330 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  51.83 
 
 
334 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  53.52 
 
 
331 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  45.21 
 
 
336 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 
340 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  33.95 
 
 
343 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
342 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
342 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
321 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 
342 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
435 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 
435 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
435 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
330 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.18 
 
 
370 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
331 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  32.96 
 
 
322 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 
334 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
347 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
326 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
667 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.54 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.19 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.68 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 
432 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
349 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.65 
 
 
334 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.4 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.47 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.47 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.47 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 
330 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
356 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.47 
 
 
345 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.47 
 
 
345 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  33.9 
 
 
387 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
667 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 
334 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 
667 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
372 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.33 
 
 
329 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.33 
 
 
337 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
333 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 
667 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
362 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
337 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
324 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
332 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 
433 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  34.71 
 
 
376 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
338 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
468 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  28.66 
 
 
328 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
328 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.63 
 
 
343 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 
399 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  24.34 
 
 
347 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.59 
 
 
334 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
336 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.22 
 
 
351 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.8 
 
 
353 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
351 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
328 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
332 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
325 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 
337 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 
369 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
365 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
334 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 
399 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
385 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  30.4 
 
 
372 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 
372 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
346 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  30.93 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.24 
 
 
335 aa  99  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  28.43 
 
 
328 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.64 
 
 
438 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
356 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.36 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  31.04 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>