More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0150 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  100 
 
 		 328 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  82.32 
 
 		 328 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  76.22 
 
 		 328 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  76.22 
 
 		 328 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  68.6 
 
 		 328 aa  474  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  64.62 
 
 		 342 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.59 
 
 		 328 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.59 
 
 		 328 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  47.17 
 
 		 322 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  45.79 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  44.31 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  43.64 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  43.73 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  41.9 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  40.12 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  40.94 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  42.09 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  39.08 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  37.11 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  35.89 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.87 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  38.08 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 667 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.4 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  33.45 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  36.33 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  30.72 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.41 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.95 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  32.24 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 667 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.36 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  36.61 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 667 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.32 
 
 		 670 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.36 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.61 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.79 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  32 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 667 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  35.18 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.83 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  29.43 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  33.07 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  35.55 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  29.43 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  33.6 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.85 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  29.13 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  29.13 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  29.62 
 
 		 451 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  28.83 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  28.83 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 665 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  28.83 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 374 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.55 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 374 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.13 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  37.99 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 458 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.47 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  31.84 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.18 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.48 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  28.74 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.17 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  30.95 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  28.66 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>