More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2288 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  76.83 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  76.63 
 
 		 342 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  76.04 
 
 		 342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  75.77 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  57.88 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  51.32 
 
 		 353 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  37.38 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.26 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.95 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  34.32 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  32.09 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 		 433 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.89 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  31.42 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  31.23 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.88 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.88 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  34 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  40.2 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  37.4 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  37.24 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  31.43 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 		 382 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.57 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.68 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.86 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.63 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.81 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  34.91 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.57 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.06 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  41.94 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.82 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  30.97 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  37.61 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 667 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 468 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 412 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  28.33 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>