More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3174 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.17 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.17 
 
 		 333 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  71.47 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  64.13 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  63.04 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  57.06 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  54.27 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  58.01 
 
 		 330 aa  355  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  53.35 
 
 		 334 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4105  oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.416688  normal  0.0136501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.43 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.27 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  32.96 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.4 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 432 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  30.55 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  27.25 
 
 		 368 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  31.34 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.03 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.03 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.03 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.03 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.03 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  31.79 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.03 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 667 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 458 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.15 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.84 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.59 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  27.62 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.15 
 
 		 388 aa  99.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  37.99 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.4 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.08 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  26.67 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  27.65 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  27.57 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  32.46 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  24.93 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.16 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  36.05 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.6 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 667 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.18 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.47 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 667 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>