More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5310 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  76.16 
 
 		 667 aa  1072    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  75.71 
 
 		 667 aa  1065    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 667 aa  1357    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  44.14 
 
 		 667 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  44.13 
 
 		 665 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.3 
 
 		 670 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 		 665 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  45.4 
 
 		 338 aa  273  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1199  aldo/keto reductase  39.4 
 
 		 316 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3897  aldo/keto reductase  38.22 
 
 		 328 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  38.53 
 
 		 329 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3216  aldo/keto reductase  38.34 
 
 		 320 aa  195  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  36.45 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  36.95 
 
 		 329 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 331 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  27.63 
 
 		 342 aa  174  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  27.63 
 
 		 342 aa  172  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  35.65 
 
 		 379 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  36.02 
 
 		 320 aa  168  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.36 
 
 		 354 aa  167  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 334 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 		 338 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 327 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 332 aa  160  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 		 331 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 349 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 321 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  35.74 
 
 		 346 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 329 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.51 
 
 		 359 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 		 334 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  31.38 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.07 
 
 		 338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  40.08 
 
 		 335 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 352 aa  147  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 		 341 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 344 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 352 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  34.84 
 
 		 328 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.36 
 
 		 333 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 		 321 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  28.77 
 
 		 349 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 329 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  34.41 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 357 aa  140  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.65 
 
 		 358 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 		 338 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  26.8 
 
 		 324 aa  137  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  32.62 
 
 		 343 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  32.68 
 
 		 319 aa  134  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 345 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.88 
 
 		 323 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 332 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.42 
 
 		 329 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.62 
 
 		 331 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 327 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 338 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2027  aldo/keto reductase  29.22 
 
 		 337 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 324 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 342 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.35 
 
 		 334 aa  130  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 362 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.87 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 328 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 336 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 340 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 322 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 323 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 342 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 336 aa  127  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.61 
 
 		 328 aa  127  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.99 
 
 		 349 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.93 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  29.58 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  29.32 
 
 		 388 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.7 
 
 		 349 aa  125  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 354 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  27.92 
 
 		 345 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  35.92 
 
 		 326 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 		 328 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 335 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 		 337 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 332 aa  123  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 325 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  28.53 
 
 		 351 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 373 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 		 330 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  30.77 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  30 
 
 		 328 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 328 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  33.56 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.9 
 
 		 327 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.69 
 
 		 361 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>