More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0394 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 468 aa  978    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  57.73 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  53.5 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  52.12 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  52.41 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  52.12 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  48.47 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  50.14 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  44.95 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  46.9 
 
 		 365 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  41.62 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  40.46 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 374 aa  269  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  41.62 
 
 		 405 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  40.94 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  38.9 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  36.84 
 
 		 344 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  38.28 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  35.93 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  37.98 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  35.82 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  34.11 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  34.2 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 		 374 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 384 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 384 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  34.11 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 385 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.17 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 362 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 332 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 331 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 337 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.86 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.25 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 667 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 344 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 		 369 aa  120  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.14 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  26.04 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.37 
 
 		 353 aa  117  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 359 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.26 
 
 		 328 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  26.8 
 
 		 329 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 327 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  22.89 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.96 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 353 aa  114  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 340 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 347 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  26.52 
 
 		 327 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  22.12 
 
 		 330 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  22.75 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  24.18 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 359 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 		 328 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.61 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 322 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>