More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4370 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 384 aa  789    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 384 aa  789    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  78.91 
 
 		 384 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  55.01 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  45.71 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  46.96 
 
 		 374 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  46.41 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  35.17 
 
 		 435 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  33.71 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  32.07 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  33.14 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  31.59 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  30.72 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.15 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  28.57 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  29.41 
 
 		 328 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  29.09 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.25 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  28.86 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.27 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 		 667 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  28.13 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  28.26 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 667 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.46 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.88 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 667 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 344 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 667 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  24.51 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.96 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.8 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.51 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  30.58 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 		 327 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.8 
 
 		 357 aa  99.4  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 325 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.21 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  31.69 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 665 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>