More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  62.54 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  64.26 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  59.59 
 
 		 352 aa  362  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  52.59 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  56.32 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  54.84 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  53.03 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  48.94 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  48.47 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  46.34 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  45.43 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  42.42 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  41.24 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  43.84 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  43.16 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  41.34 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  42.47 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  40.91 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  37.12 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  44.17 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  38.97 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  40.91 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  43.37 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  39.77 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 323 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  37.01 
 
 		 328 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  44.31 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  37 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 327 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  38.87 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  41.43 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  39.24 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  43.56 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  39.09 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  43.38 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  41.03 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  36.5 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 327 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  33.04 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.33 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  31.12 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 		 667 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  29.49 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  29.35 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 		 667 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 		 667 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 		 667 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.06 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  46.27 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.35 
 
 		 670 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  35.06 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.83 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  29.12 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.83 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.79 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.13 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  38.37 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  34.45 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  36.12 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  39.61 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 		 665 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  34.76 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.98 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  28.9 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  34.13 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.68 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.79 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  27.41 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  34.94 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  34.94 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  36.14 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 		 394 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  27.49 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  27.25 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>