More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0826 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
432 aa  878    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  72.07 
 
 
435 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  71.97 
 
 
435 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  71.72 
 
 
435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  66.05 
 
 
433 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  51.47 
 
 
458 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  47.22 
 
 
468 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  44.58 
 
 
438 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  45.63 
 
 
370 aa  333  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  43.86 
 
 
365 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
405 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  41.44 
 
 
369 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  42.29 
 
 
405 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  43.06 
 
 
405 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  38.44 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
392 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  39 
 
 
388 aa  222  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  39.17 
 
 
375 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 
349 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  33.92 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 
365 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  39.41 
 
 
374 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  39.12 
 
 
374 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  36.07 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  33.15 
 
 
362 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  35.06 
 
 
356 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 
384 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 
384 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 
385 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.05 
 
 
384 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
357 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
362 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
331 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 
361 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
321 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
330 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
357 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
324 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
332 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
337 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
347 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
336 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  28.15 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
362 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
333 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 
667 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  26.82 
 
 
328 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
336 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
342 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  33.73 
 
 
399 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
336 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.04 
 
 
327 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
353 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.52 
 
 
328 aa  107  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
334 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.3 
 
 
333 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
329 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 
328 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.22 
 
 
328 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
355 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
359 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
359 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.98 
 
 
333 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
337 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.65 
 
 
335 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
329 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 
328 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.66 
 
 
347 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
359 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.81 
 
 
334 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
349 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
332 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  25.79 
 
 
328 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
328 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 
328 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 
337 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
340 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
331 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 
331 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  34.66 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
333 aa  97.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  34.47 
 
 
329 aa  96.7  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  29.33 
 
 
360 aa  96.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>