More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1099 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  79.38 
 
 
357 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  45.81 
 
 
332 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  40.88 
 
 
334 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  41.49 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  44.35 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  41.92 
 
 
329 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 
321 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  40.84 
 
 
329 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  37.46 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 
332 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  40.35 
 
 
336 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  39.64 
 
 
331 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  37.16 
 
 
327 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  42.36 
 
 
346 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  36.75 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  37.72 
 
 
349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 
334 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 
327 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  38.81 
 
 
352 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  36.72 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  35.22 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  43.55 
 
 
379 aa  212  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  40.73 
 
 
333 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  41.29 
 
 
358 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  35.65 
 
 
326 aa  206  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  36.25 
 
 
323 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  40.66 
 
 
338 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  40.18 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  41.87 
 
 
338 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  41.85 
 
 
322 aa  198  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  40.61 
 
 
338 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  41.02 
 
 
335 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
320 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  40.74 
 
 
354 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  40.66 
 
 
342 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
370 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  36.51 
 
 
388 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 
321 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  40.48 
 
 
352 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  34.77 
 
 
351 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 
338 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  35.94 
 
 
345 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  38.01 
 
 
358 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35.48 
 
 
338 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.82 
 
 
324 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.82 
 
 
323 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
667 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.94 
 
 
349 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  46.35 
 
 
344 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.94 
 
 
349 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  32.66 
 
 
349 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.34 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.03 
 
 
359 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  31.56 
 
 
374 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.77 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
329 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  30.85 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  33.43 
 
 
348 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
667 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.4 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  32.43 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.91 
 
 
670 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
667 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  32.73 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
667 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  28.99 
 
 
332 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.53 
 
 
327 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.53 
 
 
327 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.53 
 
 
327 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  33.53 
 
 
327 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.53 
 
 
327 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  33.53 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
665 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.53 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
328 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 
328 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.37 
 
 
318 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
327 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  32.42 
 
 
328 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 
328 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  29.6 
 
 
451 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
326 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.83 
 
 
327 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>