More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6081 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 372 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  60.6 
 
 		 369 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  46.13 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  40.86 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  45.24 
 
 		 365 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  41.94 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  41.58 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  39.43 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  35.99 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  40.06 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  39.68 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  39.68 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  39.76 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  41.39 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 468 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  38.61 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  36.75 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  35.03 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.62 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 		 405 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.99 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.74 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  27.36 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.01 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.2 
 
 		 335 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 334 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  25.41 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.86 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  23.96 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.74 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.56 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  24.42 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.57 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  28.79 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>