More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1560 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 366 aa  737    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  54.24 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  45.75 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  43.49 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  44.57 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  42.62 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  44.66 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  31.79 
 
 		 438 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  33.05 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.23 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  34.7 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 433 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  32.46 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 365 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  27.51 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.46 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  29.34 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  27.38 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  33.01 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  35.11 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.1 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  32.3 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 332 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  34.14 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  30.89 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  29.96 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 667 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 667 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 667 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  37.63 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  31.54 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  27.9 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32.26 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.81 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.95 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  25.74 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  30.74 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.02 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  26.02 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  25.83 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>