More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0565 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  100 
 
 		 329 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  59.94 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  51.08 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  45.37 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  45.79 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  44.79 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.25 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.25 
 
 		 328 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  42.68 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  42.37 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  43.93 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  38.96 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  39.02 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  41.64 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  35.67 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  39.63 
 
 		 335 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  36.78 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  34.64 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.42 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 667 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 		 667 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.55 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 667 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  34.62 
 
 		 388 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 667 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  33.54 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  28.05 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.62 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  36.96 
 
 		 670 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  35.51 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  31.88 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  31.01 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  28.02 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.01 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.07 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.07 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 		 665 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  30.14 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.29 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.91 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  26.65 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  36.23 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  36.23 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.95 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.67 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  31.82 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  31.96 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  29.29 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  41.43 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.95 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  34.16 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 405 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 374 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  32.46 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  30.69 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4534  oxidoreductase domain protein  35.18 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>