More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5114 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
392 aa  821    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  48.7 
 
 
372 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  51.64 
 
 
398 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  52.69 
 
 
374 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  46.13 
 
 
372 aa  359  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  45.81 
 
 
369 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  46.67 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  43.99 
 
 
375 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  49.85 
 
 
349 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  46.76 
 
 
365 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  43.79 
 
 
365 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  45.19 
 
 
369 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  44 
 
 
362 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 
468 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  40.06 
 
 
438 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  35.01 
 
 
458 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  39.12 
 
 
435 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  37.83 
 
 
435 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 
435 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  38.9 
 
 
433 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  36.58 
 
 
432 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  35.88 
 
 
370 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  34.9 
 
 
405 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  35.78 
 
 
405 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
405 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.73 
 
 
388 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
384 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
384 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.85 
 
 
384 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
374 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
374 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
363 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
366 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 
321 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  24.76 
 
 
320 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
332 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
667 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29.76 
 
 
326 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 
359 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 
359 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
336 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.28 
 
 
328 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  27.86 
 
 
328 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
338 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.28 
 
 
328 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
334 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
358 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 
359 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  23.85 
 
 
328 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 
324 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 
362 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
342 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.2 
 
 
377 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
322 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.04 
 
 
338 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  24.83 
 
 
329 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
344 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
329 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.89 
 
 
359 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  27.17 
 
 
342 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.27 
 
 
337 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
327 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  30.05 
 
 
330 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.4 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
667 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.77 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  24.36 
 
 
343 aa  96.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.3 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
337 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.3 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.3 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.3 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
364 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.69 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 
665 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  24.55 
 
 
335 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
329 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
329 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>