More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04621 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  100 
 
 
369 aa  769    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  50.7 
 
 
362 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  50.29 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  46.78 
 
 
365 aa  318  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  46.75 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  45.19 
 
 
392 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  44.57 
 
 
398 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  41.89 
 
 
375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  41.52 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  44.67 
 
 
369 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  39.68 
 
 
372 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  40.48 
 
 
372 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  40.88 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  38.02 
 
 
438 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 
468 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  38.12 
 
 
435 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 
435 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
458 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
435 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  37.54 
 
 
432 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  36.8 
 
 
370 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 
433 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 
405 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  32.25 
 
 
405 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.62 
 
 
388 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
384 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
384 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
330 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
356 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  32.06 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.5 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 
374 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
363 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
357 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
332 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
331 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
328 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
362 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
320 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  26.65 
 
 
329 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.46 
 
 
337 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  25.3 
 
 
326 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  25.59 
 
 
334 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
337 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
369 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
357 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  34.87 
 
 
328 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 
338 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.14 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  26.85 
 
 
328 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
325 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.14 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
327 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
667 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.63 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
338 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
335 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  27.44 
 
 
330 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
362 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
667 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
359 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
667 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  29.46 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
327 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
336 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
665 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
345 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.57 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  26.56 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
667 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  23.87 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  24.78 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  24.13 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.13 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.13 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>