More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4517 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  100 
 
 		 330 aa  680    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  54.52 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  53.47 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  51.85 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  48.76 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  44.75 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.62 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.62 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  44.48 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  41.34 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  43.34 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  41.41 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  41.34 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  41.9 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  40.56 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  42.07 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  38.87 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  39.02 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  37.69 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  39.88 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  37.05 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.24 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.17 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  36.79 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  37.11 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  36.88 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  34.15 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.14 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  35.33 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 667 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  32.72 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  27.43 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.8 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.25 
 
 		 370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  30.31 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 667 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  34.63 
 
 		 408 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 667 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.07 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  32.26 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.18 
 
 		 670 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  31.8 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.23 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  23.8 
 
 		 458 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 667 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  22.12 
 
 		 468 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.16 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  25.53 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.23 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  29.28 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 665 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.26 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.02 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  31.5 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  23.32 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.54 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 665 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>