More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1266 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  45.91 
 
 
337 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  44.85 
 
 
337 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  45.37 
 
 
331 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  37.15 
 
 
330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.41 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
331 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
337 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 
330 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
324 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
325 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2126  putative NDP-hexose-3-ketoreductase  28.83 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.298904  normal  0.723629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  35.79 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  30.65 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  34.56 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  37.7 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  40 
 
 
326 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  42.46 
 
 
328 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.36 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.06 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.38 
 
 
334 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.86 
 
 
328 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  35.71 
 
 
329 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  29.57 
 
 
330 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
332 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  38.33 
 
 
328 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  33.56 
 
 
328 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  33.84 
 
 
328 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 
338 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  39.25 
 
 
345 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.84 
 
 
388 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
321 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
667 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
356 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
667 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  32 
 
 
408 aa  95.9  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.12 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
667 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.1 
 
 
370 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2895  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.47 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  33.51 
 
 
376 aa  89.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
326 aa  89.4  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
667 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 
362 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.96 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.44 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  31.02 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.96 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.62 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
320 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
347 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.84 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.84 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.84 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.84 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
665 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.3 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 
433 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  26.11 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  32.48 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.91 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.91 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.04 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  28.74 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>