More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2611 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  79.38 
 
 
320 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  58.82 
 
 
332 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  57.23 
 
 
345 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  49.84 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  37.42 
 
 
332 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 
325 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 
324 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 
336 aa  152  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  31.63 
 
 
334 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  36.68 
 
 
327 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.43 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  30.31 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  33.45 
 
 
335 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.94 
 
 
328 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
337 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  32.22 
 
 
328 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  31.19 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  32.51 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.43 
 
 
338 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
667 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 
338 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 
667 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
667 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  23.17 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
328 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 
334 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  29.69 
 
 
328 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  23.48 
 
 
342 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
328 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
332 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.49 
 
 
416 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  33.47 
 
 
665 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  35.75 
 
 
337 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
321 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  38.65 
 
 
354 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  27.86 
 
 
328 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  30.49 
 
 
329 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
357 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 
322 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  38.35 
 
 
338 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
354 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
321 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 
331 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
329 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
365 aa  99.4  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  36.81 
 
 
331 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.48 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  33.85 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4534  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.75 
 
 
670 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.18 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  33.65 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 
342 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
329 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 
356 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.98 
 
 
353 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  38.62 
 
 
379 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  35.41 
 
 
358 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
435 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
369 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.71 
 
 
435 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.97 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
435 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.04 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 
365 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
362 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.99 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
349 aa  89.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.99 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  31.89 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
372 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  24.41 
 
 
324 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.7 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
352 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 
396 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  21.2 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.73 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
386 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>