More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3482 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 337 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  49.54 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  46.06 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  46.38 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  36.95 
 
 		 332 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  33.13 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  34.12 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 		 665 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.75 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.75 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  35.32 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  29.56 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2126  putative NDP-hexose-3-ketoreductase  29.64 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.298904  normal  0.723629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  35.89 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  34.78 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  39.36 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  35.51 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  35.55 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  40.76 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.27 
 
 		 670 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.16 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  33.65 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  28.03 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 667 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  30.51 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.28 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.28 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.9 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 321 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  35.35 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  36.2 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  33.69 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 		 665 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.54 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  30.53 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  29.55 
 
 		 376 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.99 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.86 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  27.98 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  33.93 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  29.89 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  29.87 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  34.45 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.1 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 667 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.1 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  29.26 
 
 		 408 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 397 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 		 667 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  32.57 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  36.44 
 
 		 335 aa  89.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  29.41 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 		 667 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  35.92 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  30.92 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  33.07 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  33.33 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>