More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5149 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
329 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  64.11 
 
 
332 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  53.23 
 
 
334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  48.62 
 
 
332 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  47.13 
 
 
329 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  45.87 
 
 
329 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  50.62 
 
 
322 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  41.87 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  40.98 
 
 
331 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  42.15 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  40.06 
 
 
354 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  42.69 
 
 
336 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  40.84 
 
 
356 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  45.06 
 
 
338 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  43.96 
 
 
346 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  42.64 
 
 
338 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 
349 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  43.17 
 
 
333 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  39.94 
 
 
352 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
321 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  43.28 
 
 
358 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  40.61 
 
 
379 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  39.82 
 
 
357 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  44 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  43.43 
 
 
352 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  42.02 
 
 
338 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 
327 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  40.3 
 
 
338 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  35.83 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  34.59 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  41.77 
 
 
354 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  39.94 
 
 
341 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  35.66 
 
 
388 aa  205  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  39.81 
 
 
342 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  39.45 
 
 
335 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  36.26 
 
 
362 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  35.89 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  41.36 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 
667 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 
327 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
349 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  32.11 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.8 
 
 
323 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  36.2 
 
 
338 aa  175  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  32.13 
 
 
361 aa  172  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  47.03 
 
 
344 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  30.86 
 
 
374 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.86 
 
 
359 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  33.14 
 
 
351 aa  159  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
366 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 
394 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
667 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
370 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 
356 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.09 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  33.74 
 
 
328 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.59 
 
 
319 aa  146  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  34.97 
 
 
348 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
667 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.52 
 
 
349 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  33.03 
 
 
328 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.13 
 
 
349 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
329 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.37 
 
 
670 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.92 
 
 
327 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
667 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  34.66 
 
 
348 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.84 
 
 
342 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  33.74 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  33.74 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.84 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  35.58 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
383 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 
328 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
328 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.21 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
665 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 
334 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
381 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
336 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  32.63 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.32 
 
 
327 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  34.32 
 
 
327 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  32.49 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  31.27 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>