More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0834 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 329 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  47.55 
 
 		 329 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  48.77 
 
 		 329 aa  325  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  42.15 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  44.07 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  42.81 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  41.88 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  38.08 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  38.08 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  37.8 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  39.94 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  36.34 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  37.31 
 
 		 354 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  38.04 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  36.5 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  36.75 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  39.27 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  36.84 
 
 		 349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  37.65 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.86 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  37.46 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  40.31 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  39.67 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  39.38 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  36.14 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 		 338 aa  198  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  35.8 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  32.93 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  38.15 
 
 		 352 aa  195  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  34.85 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  33.14 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  36.53 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.31 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  35.69 
 
 		 354 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  32.32 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  29.86 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 667 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  33.13 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  42.42 
 
 		 344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.38 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 667 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  32.21 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  32.52 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.61 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  31.4 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.61 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 667 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 667 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  31.98 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  30.79 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.64 
 
 		 670 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  30.18 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  29.06 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  28.71 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.53 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 665 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  31.16 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 332 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  29.4 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  27.11 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  27.93 
 
 		 328 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  27.49 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  27.49 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>