More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4277 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  36.86 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.55 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  36.6 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  33.21 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  31.7 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  28.28 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.64 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.64 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  37.64 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  37.91 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  36.61 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  27.55 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.17 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.31 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  37.57 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  29.59 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  29.85 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  35.2 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 		 667 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 667 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 667 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  34.24 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.81 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 667 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  28.04 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.89 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  33.33 
 
 		 371 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 371 aa  92.4  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  29.1 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  31.34 
 
 		 376 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  34.62 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2126  putative NDP-hexose-3-ketoreductase  28.74 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.298904  normal  0.723629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.17 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  41.48 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.16 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.7 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  23.33 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.82 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.22 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4534  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  33.16 
 
 		 451 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.7 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  34.45 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.84 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 384 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 384 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.4 
 
 		 322 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  32.34 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  24.91 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  21.74 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  30.59 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>