More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6432 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 327 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  49.84 
 
 		 320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  46.77 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  46.18 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  45.48 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  39.38 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  37.81 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  38.49 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  35.78 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  36.7 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 337 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.06 
 
 		 408 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  36.11 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  37.54 
 
 		 327 aa  168  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  33.75 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.79 
 
 		 416 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  39.26 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.77 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.53 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.93 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  34.86 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32.83 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  35.41 
 
 		 665 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 667 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.98 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  33.13 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.67 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  32.31 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  34.44 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 667 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  32.23 
 
 		 388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  31.12 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 667 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  35.66 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.25 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 667 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  35.45 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 384 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 384 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 		 435 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.98 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  36.03 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 435 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 468 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.62 
 
 		 670 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  37.98 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  29.29 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.04 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  33.98 
 
 		 329 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  34.74 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  33.81 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2895  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.14 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 366 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  35.57 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  35.11 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.52 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 374 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4534  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 374 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>