More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 379 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  53.71 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  58.72 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  52.19 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  55.36 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  55.84 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  43.94 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  44.78 
 
 		 329 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  53.27 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  45.15 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  51.22 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  45.21 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  43.6 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  44.31 
 
 		 338 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  40.61 
 
 		 329 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  38.91 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  38.37 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  43.55 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  42.73 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  44.04 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  43.45 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  42.51 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  43.43 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  46.93 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  43.14 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  37.61 
 
 		 323 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  37.91 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  45.85 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  43.48 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  44.48 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  43.07 
 
 		 336 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  37.94 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  36.14 
 
 		 324 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  36.55 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  36.14 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  36.68 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  36.86 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  39.72 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  43.11 
 
 		 338 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  40.18 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 667 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  35.65 
 
 		 667 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  52.33 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.58 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  33.7 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.91 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  36.58 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  34.19 
 
 		 667 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 667 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  37.58 
 
 		 328 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.29 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.59 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.59 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  30.14 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  37.76 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  37.76 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  31.37 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  31.4 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  30.47 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  36.56 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  41.9 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  29.57 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 665 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  35.76 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  28.63 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  35.45 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 332 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.61 
 
 		 670 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 332 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  35.53 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  27.46 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.2 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.57 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  34.72 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 328 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  27.46 
 
 		 328 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 328 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>