More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2141 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  37.78 
 
 
321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 
354 aa  242  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  37.07 
 
 
329 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  37.42 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 
329 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.13 
 
 
334 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  34.59 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 
336 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 
357 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
331 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.7 
 
 
327 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 
332 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
356 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  32.4 
 
 
328 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  39.36 
 
 
352 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 
338 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
338 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  32.71 
 
 
359 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 
334 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
352 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  34.71 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.65 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  35.03 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  36.04 
 
 
667 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.59 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 
349 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 
356 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 
370 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  37.75 
 
 
323 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 
349 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  37.35 
 
 
324 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  29.65 
 
 
388 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  36.02 
 
 
667 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 
349 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  39.8 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  31.27 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
667 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 
665 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 
667 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  30.63 
 
 
345 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
338 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
331 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  29.22 
 
 
351 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  30.92 
 
 
348 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
344 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  30.47 
 
 
349 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  33.57 
 
 
361 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
323 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
348 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
354 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  32.3 
 
 
319 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
337 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
332 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  33.07 
 
 
451 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
342 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
360 aa  136  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  31.6 
 
 
328 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.81 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.07 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  32.12 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.48 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.19 
 
 
342 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  25.21 
 
 
374 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
329 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
338 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  28.41 
 
 
670 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.88 
 
 
327 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.76 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.68 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.68 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
328 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
328 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
324 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  27.54 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  31.08 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 
365 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.92 
 
 
343 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  27.59 
 
 
328 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
328 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
383 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.35 
 
 
334 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>