More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6116 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  93.7 
 
 		 667 aa  1294    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  75.71 
 
 		 667 aa  1065    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 667 aa  1357    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  47.22 
 
 		 667 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  45.11 
 
 		 665 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.39 
 
 		 670 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  40.21 
 
 		 665 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  46.9 
 
 		 338 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3897  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 328 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3216  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 320 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1199  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 316 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 		 330 aa  191  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  35.86 
 
 		 329 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.54 
 
 		 342 aa  183  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.97 
 
 		 342 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 		 329 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 349 aa  170  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 		 354 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 334 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 320 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  33.62 
 
 		 379 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 327 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 338 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 329 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 346 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 321 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 352 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  34.11 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 332 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  29.2 
 
 		 328 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 352 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.93 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 334 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 331 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 329 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  30.38 
 
 		 343 aa  144  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.05 
 
 		 359 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  31.78 
 
 		 334 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  27.73 
 
 		 349 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.14 
 
 		 333 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.2 
 
 		 329 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 330 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.14 
 
 		 344 aa  140  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.66 
 
 		 358 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 332 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.25 
 
 		 323 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.61 
 
 		 319 aa  137  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 362 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 338 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  32.3 
 
 		 331 aa  135  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.17 
 
 		 324 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 322 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  32.44 
 
 		 322 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.4 
 
 		 328 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 338 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 336 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  32.15 
 
 		 328 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 356 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 		 340 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 327 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 337 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2027  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 337 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 345 aa  127  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  30.09 
 
 		 342 aa  127  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  35.87 
 
 		 326 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  30.81 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  31.25 
 
 		 328 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 329 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 		 328 aa  124  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 328 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 		 337 aa  124  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 		 328 aa  124  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 324 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  30.23 
 
 		 328 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  32.34 
 
 		 335 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 328 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.42 
 
 		 342 aa  122  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 328 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  34.98 
 
 		 335 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 327 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 349 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 349 aa  120  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.05 
 
 		 388 aa  120  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 325 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.99 
 
 		 327 aa  117  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.77 
 
 		 361 aa  117  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 342 aa  117  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 321 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  27.48 
 
 		 351 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>