More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1543 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  100 
 
 		 331 aa  689    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  51.53 
 
 		 323 aa  349  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  51.22 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  48.63 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.91 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  41.25 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  34.72 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  30.7 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  35.95 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  30.58 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 370 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  30.93 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.84 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 		 667 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  28.65 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  29.02 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 362 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 667 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  33.83 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 667 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 667 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  29.12 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  28.96 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  28.05 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  30.51 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  27.59 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.73 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.17 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  31.58 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.91 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.91 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.27 
 
 		 670 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.42 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.07 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  23.73 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.52 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.42 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.91 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  25.6 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  26.06 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  26.28 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  26.06 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  25.68 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  29.27 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  25.76 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  28.29 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>