More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0258 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
336 aa  682    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  59.26 
 
 
325 aa  390  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  58.72 
 
 
332 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  54.63 
 
 
324 aa  363  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 
331 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 
330 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  40.74 
 
 
330 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  39.88 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  40.67 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
337 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  37.65 
 
 
335 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  37.81 
 
 
327 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  38.84 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  35.06 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  37.12 
 
 
328 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  35.89 
 
 
328 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  36.53 
 
 
328 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  35.93 
 
 
342 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.39 
 
 
328 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.39 
 
 
328 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35.03 
 
 
338 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  36.14 
 
 
327 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.43 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
667 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.33 
 
 
388 aa  159  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  38.15 
 
 
329 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
468 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  32.75 
 
 
370 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  34.47 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  31.04 
 
 
343 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 
356 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
322 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 
320 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  34.37 
 
 
329 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
337 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  37.29 
 
 
332 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  32.8 
 
 
342 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  32.42 
 
 
328 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  35.29 
 
 
329 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.58 
 
 
670 aa  135  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.19 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
458 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  31.05 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  31.96 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.55 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
332 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
667 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
435 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
337 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
667 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
329 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
667 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
435 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  35.68 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
329 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 
665 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  31.46 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
321 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
361 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.98 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.8 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.04 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 
349 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  31.76 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
329 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
323 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  33.44 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.7 
 
 
328 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 
352 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
334 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  35.04 
 
 
358 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
432 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
433 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
338 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 
336 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
392 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.38 
 
 
384 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
357 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>