More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05344 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 329 aa  686    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  60.19 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  53.4 
 
 		 326 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  52.91 
 
 		 332 aa  352  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  53.09 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  52.45 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  52.45 
 
 		 344 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  52.45 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  52.47 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  51.83 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  52.16 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.47 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  52.15 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  52.15 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  51.52 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.16 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  51.52 
 
 		 328 aa  341  9e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  51.52 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  51.52 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  51.52 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  51.52 
 
 		 328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  51.52 
 
 		 334 aa  339  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  51.52 
 
 		 334 aa  339  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  51.23 
 
 		 324 aa  338  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  46.18 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  42.51 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  42.02 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  35.69 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  34.25 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  31.94 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.09 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  30.25 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.8 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  26.87 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  28.01 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  26.33 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  31.48 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 667 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 665 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 667 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  26.72 
 
 		 379 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.28 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  25.91 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.51 
 
 		 370 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  24 
 
 		 331 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  25.76 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.85 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.7 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.52 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  24.93 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 667 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 667 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  28.63 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  36.76 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  31.75 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  24.36 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.79 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>