More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2702 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
329 aa  681    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.54 
 
 
318 aa  249  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  37.27 
 
 
320 aa  216  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  33.23 
 
 
332 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  33.23 
 
 
344 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  32.93 
 
 
344 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  32.93 
 
 
332 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  32.93 
 
 
332 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  31.71 
 
 
328 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  31.71 
 
 
328 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  32.01 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  31.4 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  31.4 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  31.4 
 
 
334 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  31.4 
 
 
334 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
328 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
327 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
326 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
332 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
324 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  29.85 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
332 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
329 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
332 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
331 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.88 
 
 
331 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.88 
 
 
331 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  29.54 
 
 
325 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  29.64 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  29.82 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.39 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  28.92 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.12 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
329 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
327 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  25.15 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
334 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  24.85 
 
 
324 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
370 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
331 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
339 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
323 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  26.48 
 
 
451 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  24.63 
 
 
329 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 
327 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  26.84 
 
 
379 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
357 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
349 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
354 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
326 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 
356 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
335 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.29 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.85 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  26.03 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  32.13 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  27.91 
 
 
333 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  27.34 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 
334 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.79 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.79 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.52 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
358 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.6 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.12 
 
 
319 aa  89.7  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  26.44 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  27.73 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  31.42 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.71 
 
 
327 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.71 
 
 
327 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.71 
 
 
327 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  23.71 
 
 
327 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.71 
 
 
327 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  33.67 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  25.68 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  23.96 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  24.33 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  24.91 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>