More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1747 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  100 
 
 
451 aa  926    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  51.49 
 
 
447 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  44.71 
 
 
464 aa  350  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  54.48 
 
 
167 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  59.68 
 
 
185 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.71 
 
 
319 aa  140  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  51.94 
 
 
144 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  33.07 
 
 
320 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.69 
 
 
131 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  44.8 
 
 
143 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  50 
 
 
133 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
329 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  50.41 
 
 
132 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
667 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 
342 aa  123  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  49.19 
 
 
127 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
142 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
133 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 
322 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
338 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 
352 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  30.63 
 
 
328 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  33.07 
 
 
329 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
354 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  28.1 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  26.18 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.82 
 
 
139 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
323 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  45.53 
 
 
131 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 
327 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  49.19 
 
 
187 aa  114  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  29.3 
 
 
328 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
328 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  44.72 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  28.03 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.62 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  28.86 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  46.43 
 
 
116 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 
328 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
132 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.5 
 
 
342 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  42.5 
 
 
131 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
331 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  34.31 
 
 
323 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  34.31 
 
 
324 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 
356 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
329 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
128 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  42.98 
 
 
130 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  40.83 
 
 
130 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
335 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  32.56 
 
 
351 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
329 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  33.88 
 
 
334 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.19 
 
 
331 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  43.9 
 
 
129 aa  104  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
338 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.12 
 
 
342 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
327 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  33.74 
 
 
362 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  31.96 
 
 
343 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  28.16 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 
331 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 
332 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  28.16 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  34.41 
 
 
344 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
327 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 
326 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  31.17 
 
 
379 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.58 
 
 
327 aa  100  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.57 
 
 
349 aa  99.8  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 
356 aa  99.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.57 
 
 
349 aa  99.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
327 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
356 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  29.17 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
335 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
665 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.3 
 
 
319 aa  99  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  29.72 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.35 
 
 
318 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>