More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0110 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
349 aa  717    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  99.43 
 
 
349 aa  712    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  69.65 
 
 
356 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.15 
 
 
334 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  34.87 
 
 
338 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 
329 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.83 
 
 
359 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
320 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 
338 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
331 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
321 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 
335 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 
327 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
356 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
346 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
362 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 
327 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  33.47 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 
336 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  34.28 
 
 
352 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  29.67 
 
 
328 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 
338 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  31.59 
 
 
379 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  34.52 
 
 
329 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
322 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
338 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 
357 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.25 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
338 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  39.2 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 
366 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  30.72 
 
 
333 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 
667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
338 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.57 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  36.95 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  27.82 
 
 
381 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  31.25 
 
 
348 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  30.74 
 
 
323 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  30.35 
 
 
324 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  29.79 
 
 
319 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 
667 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
348 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
381 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  27.32 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
667 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  25.13 
 
 
388 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  33.59 
 
 
334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.54 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.58 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.91 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  33.07 
 
 
329 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.21 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
329 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.64 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
360 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
334 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 
345 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.24 
 
 
318 aa  105  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
327 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
331 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
332 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.16 
 
 
319 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  31.69 
 
 
342 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  31.15 
 
 
342 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.47 
 
 
328 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.99 
 
 
353 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
330 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
328 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  31.08 
 
 
328 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
325 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  29.75 
 
 
328 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
324 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  33.46 
 
 
328 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  29.91 
 
 
328 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  30.28 
 
 
326 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
328 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  26.39 
 
 
374 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  26.57 
 
 
451 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.37 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  30 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>