More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3695 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 		 130 aa  270  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  80.77 
 
 		 130 aa  225  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  70.77 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  64.8 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  62.99 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  62.9 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  63.93 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  66.4 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.8 
 
 		 167 aa  129  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.44 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.9 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  48.33 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  46.67 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  45.45 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  40.83 
 
 		 451 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  37.4 
 
 		 464 aa  104  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.17 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  42.19 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.07 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  37.69 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  39.52 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  36.36 
 
 		 512 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35.07 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  37.68 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  36.43 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  30.66 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  37.78 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  38.64 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  34.09 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  43.75 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  36.59 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4011  transketolase  57.63 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  34.09 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  35.82 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  34.92 
 
 		 371 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  41.49 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  32.81 
 
 		 495 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  35.9 
 
 		 501 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  36.15 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0176  cytidyltransferase-related  38.78 
 
 		 469 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.984129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  34.33 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  40 
 
 		 487 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  37.89 
 
 		 490 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  35.61 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  33.33 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  35.38 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  38.95 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4229  cytidyltransferase-related protein  41.84 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.07 
 
 		 481 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0022  cytidyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 366 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.112935  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  32.28 
 
 		 455 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0105  cytidyltransferase-like protein  41.24 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  36.09 
 
 		 491 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  41.11 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  29.92 
 
 		 337 aa  63.5  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0201  rfaE bifunctional protein  41.24 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2543  rfaE bifunctional protein  37.11 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  41.11 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  37.23 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  41.11 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  37.23 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0487  rfaE bifunctional protein  40.82 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0367  ADP-D-glycero-D-manno-heptose synthase  37.96 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0870794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  37.89 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  41.11 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  37.89 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  30.77 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3975  rfaE bifunctional protein  34.35 
 
 		 562 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0444  aut protein  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3207  cytidyltransferase-like protein  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4360  rfaE bifunctional protein  33.59 
 
 		 643 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0405663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0072  cytidyltransferase-like protein  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0607  bifunctional ADP-heptose synthase  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2819  rfaE bifunctional protein  37.04 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675163  normal  0.258332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  34.62 
 
 		 472 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  37.11 
 
 		 472 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0238  cytidyltransferase-like protein  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0425  aut protein  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1355  cytidyltransferase-like protein  40.82 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29998  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  32.98 
 
 		 488 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  39.78 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  34.38 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.33 
 
 		 502 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2296  cytidyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  31.58 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0715  rfaE bifunctional protein  32.56 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.970718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  32.62 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  37.76 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  31.91 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>