194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0245 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  100 
 
 
512 aa  1065    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4996  hypothetical protein  34.43 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.910957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  39.71 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  34.53 
 
 
152 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  35.38 
 
 
131 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  36.36 
 
 
130 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  37.4 
 
 
130 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  33.59 
 
 
131 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  36.8 
 
 
146 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  34.06 
 
 
153 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  33.59 
 
 
131 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  32.56 
 
 
147 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  33.83 
 
 
132 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
167 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.12 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  31.11 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.61 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  31.58 
 
 
148 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
133 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  34.11 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
185 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
131 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.56 
 
 
132 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.56 
 
 
132 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.26 
 
 
132 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  32.58 
 
 
160 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  47.89 
 
 
156 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  27.46 
 
 
139 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
133 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.63 
 
 
127 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.66 
 
 
142 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.94 
 
 
151 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.53 
 
 
187 aa  60.1  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  29.2 
 
 
464 aa  59.7  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.22 
 
 
128 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  31.06 
 
 
163 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  31.06 
 
 
163 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.66 
 
 
144 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  32.69 
 
 
170 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  43.84 
 
 
151 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  44.44 
 
 
163 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  31.06 
 
 
163 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  36.11 
 
 
225 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  31.21 
 
 
495 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  30.37 
 
 
451 aa  57  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  35.92 
 
 
169 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  37.25 
 
 
151 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  27.23 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  42.25 
 
 
150 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  42.25 
 
 
150 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1676  rfaE bifunctional protein  34.17 
 
 
162 aa  56.2  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  42.25 
 
 
150 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  31.97 
 
 
358 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  38.1 
 
 
477 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  31.97 
 
 
358 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  29.6 
 
 
116 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  30.61 
 
 
163 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  30.52 
 
 
185 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  29.05 
 
 
143 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  30.88 
 
 
447 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  33.65 
 
 
158 aa  54.3  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  31.29 
 
 
496 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  42.11 
 
 
149 aa  53.9  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  32.17 
 
 
488 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  37.97 
 
 
177 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  41.43 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  32.12 
 
 
223 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  31.19 
 
 
206 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  33.66 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  36.63 
 
 
162 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0176  cytidyltransferase-related  32.3 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.984129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  30.71 
 
 
167 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0105  cytidyltransferase-like protein  29.34 
 
 
171 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  44.93 
 
 
143 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2810  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.27 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  28.78 
 
 
175 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66060  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.71 
 
 
474 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  32.04 
 
 
458 aa  50.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  33.98 
 
 
468 aa  50.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1969  rfaE bifunctional protein  42.86 
 
 
162 aa  50.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  32.52 
 
 
457 aa  50.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.71 
 
 
474 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  31.16 
 
 
488 aa  50.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  37.62 
 
 
158 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  33.61 
 
 
161 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44680  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.03 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290309  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  33.65 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  33.67 
 
 
172 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.79 
 
 
476 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1286  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  31.36 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0946  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.24 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.770525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0937  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.24 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  29.37 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3086  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.24 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.521766  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0886  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  38.24 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.685525  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3200  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.71 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.923411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0849  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  40 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0201  rfaE bifunctional protein  45.45 
 
 
160 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3069  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  40 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>