211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4994 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
158 aa  318  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  39.71 
 
 
512 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  36.5 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  36.69 
 
 
148 aa  89  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  40.94 
 
 
160 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  38.35 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  35.25 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  36.09 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  40.29 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  40.29 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  35.07 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  40.29 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  31.82 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  37.31 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  37.31 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.33 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  31.34 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  28.17 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  34.51 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  40.22 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  28.47 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0310  cytidyltransferase-related domain protein  40 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.531506  normal  0.452914 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.32 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  32.86 
 
 
173 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  35.05 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  31.34 
 
 
129 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  37.5 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  36.96 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  35.79 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  35.66 
 
 
358 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  35.66 
 
 
358 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2296  cytidyltransferase-like protein  29.86 
 
 
149 aa  58.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  35.34 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  35.87 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.24 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  27.74 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  40 
 
 
455 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  30.66 
 
 
363 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  34.34 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  30.66 
 
 
495 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  35.87 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  37.23 
 
 
487 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1930  cytidyltransferase-related domain protein  35.11 
 
 
226 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.791436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  38.03 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1736  cytidyltransferase-like protein  32.43 
 
 
216 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.355762  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  39.18 
 
 
461 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  37.23 
 
 
487 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01357  cholinephosphate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G09290)  34.75 
 
 
451 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.48081  normal  0.256362 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  31.78 
 
 
225 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  31.08 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  27.82 
 
 
464 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1764  cytidyltransferase-like protein  38.54 
 
 
501 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4715  rfaE bifunctional protein  41.1 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  27.82 
 
 
133 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.11 
 
 
490 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1750  cytidyltransferase-like protein  41.54 
 
 
502 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  26.12 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  37.23 
 
 
490 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  28.99 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  35.71 
 
 
486 aa  51.2  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  31.37 
 
 
206 aa  50.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  41.54 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  36.17 
 
 
501 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1245  cytidyltransferase-like protein  32.38 
 
 
241 aa  50.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0187562  hitchhiker  0.00542026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  34.04 
 
 
490 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  31.4 
 
 
468 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4360  rfaE bifunctional protein  35.11 
 
 
643 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0405663 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  31.25 
 
 
472 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2261  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.84 
 
 
477 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2196  cytidyltransferase-related  41.67 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  34.38 
 
 
490 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2116  cytidyltransferase-related domain protein  32.29 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1065  rfaE bifunctional protein  38.3 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25.37 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0621  cytidyltransferase-related domain protein  31.29 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25.37 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3975  rfaE bifunctional protein  35.11 
 
 
562 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  35 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  40 
 
 
488 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5668  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.35 
 
 
490 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25.37 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  34.74 
 
 
386 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  36.92 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0022  cytidyltransferase-like protein  28.47 
 
 
366 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.112935  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1909  cytidyltransferase-related domain protein  34.38 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  39.34 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44680  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.38 
 
 
474 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  34.69 
 
 
488 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  26.67 
 
 
371 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2404  cytidyltransferase-related  33.68 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2810  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  40.98 
 
 
477 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04100  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  29.5 
 
 
453 aa  47.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00623495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  32.35 
 
 
501 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  33.67 
 
 
488 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  29.32 
 
 
447 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1062  cytidyltransferase-like protein  41.54 
 
 
508 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>