285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
133 aa  276  7e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  68.46 
 
 
139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  69.84 
 
 
132 aa  190  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  69.05 
 
 
132 aa  190  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  69.05 
 
 
132 aa  190  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  66.4 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  61.9 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  57.94 
 
 
167 aa  168  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  65.87 
 
 
128 aa  167  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  56.15 
 
 
185 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  54.69 
 
 
133 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  53.08 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  51.54 
 
 
143 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  65.22 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  53.08 
 
 
142 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  52.76 
 
 
151 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  51.56 
 
 
187 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  51.22 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  48.76 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  50 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  47.93 
 
 
464 aa  127  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  47.15 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  47.15 
 
 
131 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  45.9 
 
 
130 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  42.86 
 
 
447 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
132 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  45 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  47.15 
 
 
129 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
152 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  37.1 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  35.61 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4011  transketolase  53.57 
 
 
73 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  31.34 
 
 
512 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  31.82 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  33.59 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  34.62 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  38.14 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  39.13 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  35.25 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  38.54 
 
 
488 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  31.5 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04303  phosphoethanolamine (AFU_orthologue; AFUA_4G05940)  30.77 
 
 
442 aa  59.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0916594  normal  0.13983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2338  rfaE bifunctional protein  34.62 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  40 
 
 
320 aa  58.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  38.28 
 
 
461 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  29.63 
 
 
363 aa  57.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2823  rfaE bifunctional protein  33.07 
 
 
200 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  39.18 
 
 
457 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  33.85 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.09 
 
 
437 aa  57  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  33.85 
 
 
477 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0022  cytidyltransferase-like protein  29.41 
 
 
366 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.112935  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  38.95 
 
 
501 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  34.13 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  28.99 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1494  cytidyltransferase-like protein  27.94 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.249918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0461  rfaE bifunctional protein  37.5 
 
 
464 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.640202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  32.81 
 
 
223 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  32.28 
 
 
495 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1062  cytidyltransferase-like protein  35.71 
 
 
508 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  43.08 
 
 
225 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.46 
 
 
482 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  37.68 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  32.04 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  34.72 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  37.5 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  32.04 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  36.08 
 
 
472 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  36.46 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  33.33 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  34.07 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3812  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.05 
 
 
476 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  27.82 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0303  rfaE bifunctional protein  42.86 
 
 
477 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  33.85 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  34.38 
 
 
143 aa  52  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  31.06 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.81 
 
 
481 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0578  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  34.02 
 
 
461 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1286  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  33.67 
 
 
461 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0292  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.46 
 
 
476 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0645  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.46 
 
 
476 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0564  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.46 
 
 
476 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  34.88 
 
 
484 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  42.42 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  34.02 
 
 
458 aa  51.2  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  34.74 
 
 
161 aa  50.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3563  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.38 
 
 
478 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0769  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.03 
 
 
479 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  34.34 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  23.85 
 
 
433 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0240  putative transferase protein  35.42 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  32.35 
 
 
337 aa  50.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  34.02 
 
 
472 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  41.18 
 
 
490 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4289  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.46 
 
 
476 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  34.69 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3605  bifunctional ADP-heptose synthase  32.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>