More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1413 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  100 
 
 		 433 aa  888    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  57.61 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  53.22 
 
 		 310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  53.22 
 
 		 310 aa  329  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  50.34 
 
 		 303 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  50.34 
 
 		 303 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  37.98 
 
 		 561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.98 
 
 		 561 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.98 
 
 		 561 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.98 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.98 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.98 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.63 
 
 		 562 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  35.14 
 
 		 564 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.93 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.93 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.93 
 
 		 562 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.93 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.59 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.59 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.59 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.59 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.49 
 
 		 568 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.42 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.46 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  36.49 
 
 		 578 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.49 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.49 
 
 		 556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.16 
 
 		 299 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  34.74 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  36.67 
 
 		 328 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  34.51 
 
 		 290 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.95 
 
 		 319 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.39 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  28.57 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  30.16 
 
 		 282 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  31.8 
 
 		 292 aa  90.5  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  31.19 
 
 		 292 aa  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  28.07 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  30.41 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  30.09 
 
 		 292 aa  87.4  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.14 
 
 		 212 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  30.73 
 
 		 292 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  28.52 
 
 		 295 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  28.39 
 
 		 295 aa  86.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  29.3 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  28.85 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  29.03 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  29.36 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  29.23 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  29.23 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  26.01 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  29.23 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  29.01 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  27.17 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  29.77 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  27.78 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  28.11 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  31.96 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  30.17 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  30.37 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  31.8 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  30.37 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  31.8 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  27.65 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  31.05 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  29.11 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  31.65 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  28.3 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  28.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  28.04 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  27.38 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  28.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  28.5 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  27 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  31.19 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  31.19 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  28.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  26.04 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  31.19 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  31.19 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  32.23 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  27.57 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  27.24 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  29.48 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  28.52 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  31.28 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.68 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  26 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  27.92 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>