More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1054 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  62.63 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  62.63 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  62.28 
 
 		 284 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  61.92 
 
 		 284 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.76 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  46.95 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  45.49 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  44.28 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  45.55 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  44.81 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  42.28 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  45.45 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  45.45 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  48.85 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  42.24 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  42.09 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  44.57 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  44.07 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  43.31 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  42.39 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  42.64 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  41.52 
 
 		 312 aa  217  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  44.44 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  46.86 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.68 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  41.95 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  42.24 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  41.79 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  43.77 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  42.12 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  48.85 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 312 aa  208  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  39.16 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  42.05 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  43.37 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  41.43 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  45.02 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  47.33 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  40.14 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  35.84 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  42.32 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  43.61 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  41.39 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  46.15 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  40 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  42.12 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.7 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  43.61 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  43.61 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  46.5 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  44.96 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  41.03 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.03 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  41.03 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  41.03 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  38.73 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  48.02 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  40.84 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  40.84 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  43.02 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  43.27 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.03 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.03 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  42.45 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  41.03 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  41.32 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  42.04 
 
 		 292 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  40.29 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  44.49 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.03 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  43.17 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  41.52 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  44.7 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  41.63 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.03 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  40.79 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  45.04 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.24 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  43.4 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  39.05 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  41.63 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  40.46 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  40.08 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  43.4 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  42.45 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  40.7 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  43.83 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  40.46 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  40.46 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  46.52 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  38.03 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  40.08 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  40.08 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  40.08 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  38.69 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  40.53 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  41.88 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>