More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4757 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  63.16 
 
 
291 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  57.54 
 
 
289 aa  361  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  45.36 
 
 
288 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.71 
 
 
289 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  45.52 
 
 
287 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.17 
 
 
292 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  42.2 
 
 
299 aa  235  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  43.62 
 
 
284 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  49.82 
 
 
289 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  44.57 
 
 
292 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  43.42 
 
 
292 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  41.64 
 
 
287 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  41.67 
 
 
304 aa  223  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  42.65 
 
 
312 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  40 
 
 
287 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.71 
 
 
288 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  44.53 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  44.06 
 
 
308 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  41.49 
 
 
289 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  46.85 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  39.16 
 
 
287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  40.94 
 
 
306 aa  219  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  41.88 
 
 
287 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  40.14 
 
 
293 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  41.13 
 
 
325 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  41.3 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  37.41 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  36.97 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  39.22 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  41.85 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.85 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  40.07 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  45.16 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  38.87 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  38.87 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  38.52 
 
 
284 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  38.33 
 
 
294 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  40.74 
 
 
295 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  38.93 
 
 
295 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  36.59 
 
 
296 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  40.77 
 
 
286 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.171622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  40.46 
 
 
285 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 
302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 
302 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 
302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  39.78 
 
 
302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  39.78 
 
 
302 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  39.78 
 
 
302 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  39.43 
 
 
302 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  37.98 
 
 
286 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  40.42 
 
 
286 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 
302 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.78 
 
 
302 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  39.43 
 
 
302 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  39.78 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  37.37 
 
 
301 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  36.97 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.86 
 
 
278 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  38.03 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  37.28 
 
 
292 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  36.93 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  39.15 
 
 
304 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4325  2,3-dimethylmalate lyase  39.58 
 
 
285 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  36.79 
 
 
295 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  36.59 
 
 
292 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  36.46 
 
 
292 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  38.62 
 
 
322 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  36.93 
 
 
296 aa  185  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  35.89 
 
 
292 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  38.4 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  38.4 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  38.4 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  35.71 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  37.05 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  35.19 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  37.02 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  37.02 
 
 
297 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  38.4 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  40 
 
 
298 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  40 
 
 
298 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  37.5 
 
 
297 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  37.98 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  37.65 
 
 
298 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  36.64 
 
 
297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  38.02 
 
 
292 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  35.21 
 
 
297 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  35.21 
 
 
297 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  38.84 
 
 
292 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  38.02 
 
 
292 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  36.64 
 
 
297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  36.64 
 
 
297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  38.02 
 
 
292 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  38.02 
 
 
292 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  38.02 
 
 
292 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  37.72 
 
 
306 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  35.76 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  34.05 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  35.89 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  39.85 
 
 
314 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>