More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0509 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  45.76 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  46.74 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  39.86 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  42.64 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  49.37 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  42.96 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  42.51 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  46.85 
 
 		 287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  46.32 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  43.01 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  46.34 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  44.28 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  40.69 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  41.2 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.2 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  40.56 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  40.21 
 
 		 286 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  40.14 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  42.63 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  43.7 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  40.73 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  40.32 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  40.32 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  41.44 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  45.93 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.06 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  39.92 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  45.06 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  43.82 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  43.87 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  41.4 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  41.2 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  39.93 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  42.23 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  39.93 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  42.11 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  42.11 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  42.31 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  42.11 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  40.7 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.11 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.11 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.11 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  42.11 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57236  methylisocitrate lyase (2-methylisocitrate lyase)  40.28 
 
 		 299 aa  191  8e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.703646  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.11 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  42.29 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.11 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  41.7 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  43.15 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  43.35 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  39.04 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.71 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  39.35 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  36.94 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  37.8 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  44.4 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  38.34 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  37.94 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  39.77 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  40 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  38.21 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  38.21 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  38.21 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  36.86 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  37.5 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  36.01 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  36.5 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  37.86 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  37.86 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  39.01 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  36.5 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  39.74 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1459  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  48.85 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  36.5 
 
 		 292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  42.15 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  37.45 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  37.74 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  36.49 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  38.62 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2655  2,3-dimethylmalate lyase  42.22 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147366  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  42.36 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  38.89 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  36.64 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  38.13 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  44.05 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  37.77 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  36.8 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  35.34 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  40.17 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  38.08 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  35.69 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  36.78 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  37.77 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  34.63 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  34.63 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  34.63 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>