More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  100 
 
 		 312 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  75.75 
 
 		 312 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  73.42 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  71.76 
 
 		 301 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  68.49 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  66.33 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  69.93 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  64.04 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  57.05 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  60.07 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2655  2,3-dimethylmalate lyase  63.9 
 
 		 292 aa  316  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147366  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  45.45 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  51.74 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  43.93 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  44.52 
 
 		 311 aa  245  9e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  49.23 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  43.57 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  43.58 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  46.51 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  48.46 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  44.03 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  45.86 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  47.39 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  46.27 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  46.27 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  46.27 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  48.84 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  54.27 
 
 		 419 aa  238  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  45.66 
 
 		 285 aa  238  8e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  43.82 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  43.26 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  45.9 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  43.88 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  44.91 
 
 		 274 aa  236  4e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  43.94 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  42.27 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  45.28 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  43.46 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  45.94 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  45.28 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  43.38 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  45.82 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.53 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  45.82 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  45.82 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  47.86 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  42.71 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  43.53 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  47.86 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  43.53 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0403  2-methylisocitrate lyase  45.82 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  45.45 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  42.7 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  43.53 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.53 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.53 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  43.53 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  43.4 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  45.45 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  45.45 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.53 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  47.69 
 
 		 294 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.53 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4722  2-methylisocitrate lyase  43.73 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53940  2-methylisocitrate lyase  43.73 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  47.74 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  42.28 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  43.38 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  42.28 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  42.91 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  44.19 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  42.28 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  47.57 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3275  methylisocitrate lyase  45.45 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  47.18 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  42.28 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  42.2 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  42.28 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  42.55 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  42.66 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  46.24 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  47.19 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  44.6 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  41.44 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  42.91 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  45.07 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  45.07 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  43.48 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  42.66 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  45.07 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  42.56 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  46.72 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1808  2-methylisocitrate lyase  46.44 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  44.72 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  44.48 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  43.4 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  44.48 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>