More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1614 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 295 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  72.92 
 
 		 293 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  72.92 
 
 		 293 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  73.84 
 
 		 295 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  68.94 
 
 		 294 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  67.03 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  68.5 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  68.5 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  58.11 
 
 		 293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  55.96 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  45.85 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  54.93 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  48.69 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  44 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  43.97 
 
 		 289 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  45.99 
 
 		 325 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  44.07 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  45.64 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.86 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  46.03 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  38.41 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  45.34 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  46.77 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  45.34 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  38.54 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  38.19 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  44.2 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  41.79 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  45.16 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  45.16 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  45.16 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  48.25 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  47.04 
 
 		 298 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  47.04 
 
 		 298 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  44.8 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  36.88 
 
 		 288 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  38.19 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  45.85 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  40 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  44.09 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  43.55 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  43.55 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  46.25 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  40.5 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  41.42 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  45.02 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  46.72 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  46.25 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  38.93 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  43.58 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  43.58 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  38.57 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  42.4 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  45.34 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.44 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  42.24 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  43.58 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  43.58 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  40.07 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  39.36 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  41.61 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  40 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  43.19 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  39.07 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  42.22 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  40.83 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  43.7 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  41.3 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  44.59 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.37 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  40.48 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.22 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.22 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.22 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  43.7 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  43.1 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  39.72 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  45.71 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  40.22 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  41.15 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  46.32 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.22 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.22 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  42.76 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  39.29 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  39.86 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  36.39 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  39.73 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0288  2-methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804341  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0879  2-methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1870  2-methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0382  2-methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332108  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2143  2-methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>