More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2378 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  99.34 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  99.34 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  99.01 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  99.01 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  99.34 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  99.34 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  99.01 
 
 
302 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  99.01 
 
 
302 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  99.01 
 
 
302 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  94.37 
 
 
302 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  67.33 
 
 
307 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  52.82 
 
 
307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  55.48 
 
 
304 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  50.83 
 
 
306 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  50.34 
 
 
305 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  51.16 
 
 
306 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  50.53 
 
 
312 aa  295  6e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  50.52 
 
 
304 aa  290  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  52.35 
 
 
304 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  52.08 
 
 
308 aa  287  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  52.83 
 
 
285 aa  285  7e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  51.29 
 
 
274 aa  280  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  50.92 
 
 
306 aa  278  7e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  50.18 
 
 
311 aa  276  4e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  50 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  50.18 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1346  methylisocitrate lyase  49.83 
 
 
304 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183799  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  48.95 
 
 
306 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2421  2-methylisocitrate lyase  49.09 
 
 
293 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  47.27 
 
 
291 aa  258  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  49.45 
 
 
292 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  49.45 
 
 
292 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  48.86 
 
 
297 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  48.36 
 
 
295 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  49.45 
 
 
292 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  50 
 
 
290 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  50 
 
 
290 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  46.83 
 
 
296 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  46.64 
 
 
295 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  45.71 
 
 
304 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  47.83 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  48.08 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  46.18 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  48.73 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  47.73 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  45.14 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  47.83 
 
 
296 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  45.88 
 
 
292 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  47.83 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  44.25 
 
 
296 aa  252  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  47.14 
 
 
298 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  45.52 
 
 
292 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  48 
 
 
292 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  48 
 
 
292 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  47.1 
 
 
294 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  48 
 
 
292 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  48 
 
 
292 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  46.29 
 
 
292 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  46.24 
 
 
292 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  48 
 
 
292 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  45.52 
 
 
292 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  45.39 
 
 
303 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  42.12 
 
 
302 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  47.67 
 
 
294 aa  248  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  45.58 
 
 
292 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  45.94 
 
 
295 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  46.74 
 
 
296 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  46.91 
 
 
297 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  47.99 
 
 
296 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  46.95 
 
 
296 aa  246  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  46.55 
 
 
297 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  48.36 
 
 
294 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  46.64 
 
 
298 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  46.52 
 
 
304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  45.91 
 
 
298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  45.16 
 
 
292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  44.95 
 
 
298 aa  245  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  45.55 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  44.06 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  44.88 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  46.01 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1808  2-methylisocitrate lyase  47.1 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  45.82 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  45.82 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  46.59 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  46.38 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  45.82 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4722  2-methylisocitrate lyase  46.74 
 
 
298 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  46.24 
 
 
296 aa  243  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53940  2-methylisocitrate lyase  46.74 
 
 
298 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  45.29 
 
 
297 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  45.29 
 
 
297 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  45.07 
 
 
296 aa  241  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  45.07 
 
 
296 aa  241  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  45.07 
 
 
296 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  46.18 
 
 
297 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  45.07 
 
 
296 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  44.88 
 
 
311 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3275  methylisocitrate lyase  45.07 
 
 
296 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>