239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0910 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  99.67 
 
 		 303 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  56.51 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  55.82 
 
 		 310 aa  340  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  53 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  50.34 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  38.97 
 
 		 564 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.96 
 
 		 561 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.96 
 
 		 562 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  35.62 
 
 		 561 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 		 561 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 		 561 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.5 
 
 		 568 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 		 561 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.92 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.62 
 
 		 562 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.79 
 
 		 562 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.79 
 
 		 562 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.79 
 
 		 562 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 		 562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 		 562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 		 562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.43 
 
 		 562 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.04 
 
 		 581 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  35.66 
 
 		 578 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.96 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.4 
 
 		 545 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.78 
 
 		 556 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  34.38 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  34.81 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.22 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  32.87 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.25 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  31.39 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.43 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  32.61 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  29.44 
 
 		 292 aa  85.9  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  29.71 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  30.2 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  29.52 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  32.3 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  26.92 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  29.33 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  29.56 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  33.47 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  25.86 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  32.82 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  32.82 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  27.94 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  28.21 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  28.22 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  32.82 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  27.4 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1524  2,3-dimethylmalate lyase  30.66 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  31.4 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  27.47 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  32.31 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  30.98 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  30.26 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  26.47 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  27.96 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.29 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.04 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  29.6 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  29.33 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  26.9 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  30.69 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  26.84 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  27.92 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  28.8 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  27.82 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  30.05 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  27.92 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  29.85 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  37.23 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  33.71 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  27.3 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  27.3 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  28.57 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  29.55 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  26.01 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  25.94 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  28.16 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  30.73 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  29.02 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  29.02 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  37.31 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  29.02 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  25 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  27.18 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  29.6 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  28.2 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  25.93 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  29.02 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.94 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  26.09 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  28.87 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  26.07 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  28.36 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>