More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0160 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  42.59 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  41.61 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  41.06 
 
 		 568 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  43.73 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 581 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  42.05 
 
 		 561 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 561 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 561 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  42.05 
 
 		 578 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  41.06 
 
 		 562 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 561 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  39.57 
 
 		 562 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.07 
 
 		 545 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 561 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 562 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  41.67 
 
 		 564 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  40 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  40 
 
 		 556 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  38.4 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.76 
 
 		 437 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.4 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.81 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.45 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  34.16 
 
 		 433 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  32.09 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  31.74 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  34.2 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  30.72 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  37.96 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  37.96 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  32 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.18 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  31.72 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.01 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  34.01 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.01 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.01 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  34.01 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  34.01 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  34.01 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  31.23 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  39.66 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.01 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  39.66 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  39.66 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.01 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  31.63 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  30.8 
 
 		 287 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  33.56 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  39.11 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  30.26 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  30.8 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  32.06 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  30.38 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  31.56 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  31.85 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  35.56 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  30.53 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  29.66 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  28.08 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  29.83 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  30.26 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  30.6 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  30.6 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  31.62 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  30.6 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  30.26 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  30.63 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  31.23 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  30.25 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  27.43 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  29.75 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  32.47 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  29.72 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  30.25 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  29.23 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  30 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  35.24 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  35.24 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.64 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  31.64 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  29.45 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  29.72 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  29.45 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.45 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  29.45 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  32.08 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  29.86 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  31.71 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  29.45 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  31.54 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  29.56 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>